Para resolver, primeiro exclua o afastamento de férias do eSocial e, em seguida, realize a exclusão das férias coletivas do sistema.
1 - Acesse o menu Processos > Afastamentos;
2 - Informe o Colaborador, selecione as férias que deseja excluir e clique no botão [Excluir eSocial Início];
3 - No Painel de Pendências do eSocial, acompanhe a validação do evento S-3000;
4 - Após, acesse o menu Processos > Férias > Coletivas e realize a exclusão das férias;
5 - Por fim, se necessário, recalcule as folhas do colaborador e reenvie os eventos S-1200 e S-1210 ao eSocial.