Essa mensagem é apresentada quando você indica uma outra empresa como 'Origem dos históricos', porém na sua empresa já tem históricos cadastrados.
Para a correção do erro você deve avaliar que antes da configuração dos Parâmetros, será necessário excluir todos os históricos atuais da empresa:
Importante!
Se a empresa está marcada para '[x] Centralizar a Contabilidade entre Matriz e Filiais', desmarque, realize os passos abaixo e marque novamente a opção.
Utilitário de Exclusão
1 - Acesse o menu Utilitários > Exclusão > Históricos;
2 - Selecione '[x] Todos os históricos' e clique em [Excluir];
3 - Confirme a exclusão dos cadastros.
Parâmetros
1 - Acesse o menu Controle > Parâmetros;
2 - Na guia Geral > Opções, realize as configurações novamente;
3 - Clique em [Gravar] para concluir, avaliando que a mensagem não será mais apresentada.
Caso você queira apenas ter em sua empresa alguns históricos encontrados em uma outra empresa do banco, você pode acessar essa empresa e no cadastro dos Históricos, replicar para a empresa desejada.