Geralmente este erro ocorre, quando é selecionada uma opção no momento da importação (entradas, saídas, canceladas), e o documento importado não está de acordo com a opção selecionada.
Exemplo: Selecionar na importação 'Notas de Entradas' e o documento que está importando para essa empresa é uma saída.
1 - Primeiramente verifique se o CT-e ou CT-e OS que está importando é de entrada, saída, ou cancelado.
2 - Após na tela de importação, no quadro IMPORTAR, selecione a opção correta para o tipo de nota que está importando.
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[Importar], verifique que o erro deixará de ocorrer e as notas serão importadas com Sucesso!