Este erro ocorre quando no XML do evento de Estabelecimentos (S-1005) foi informado dados do FAP, porém já existe a informação na Tabela FAP.
Para essa situação basta remover as tags relacionadas ao FAP no XML, dessa forma:
1. Na linha do evento Invalidado, clique no botão [...] Reticências da coluna XML;
2. Abaixo da tag 'cnaePrep' exclua as tags:
<aliqGilrat>
<fap>X.0000</fap>
</aliqGilrat>
3. Após, clique no menu Arquivo > Salvar;
4. Selecione o evento invalidado e clique em [Enviar].